Neyi hangi sırada yapmak istediğini tam olarak anlayamadım ama herşeyden önce bir tavsiyede bulunayım. Değiştirmek istediğin şeyler renk, Texture, roughness değeri gibi şeyler ise ID başına tek bir materyal kullanıp, bu materyal içerisinde istediğin birimleri parametre haline getirip değiştirmen daha iyi olur. Opaque > Translucent gibi blend mode değiştirmen gerekmediği sürece materyal değiştirmene hiç gerek yok.